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  济宁医学院学报  2017, Vol. 40 Issue (4): 295-300  DOI:10.3969/j.issn.1000-9760.2017.04.015
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刘新, 闫波. SIRT7生物学功能与人类疾病研究进展[J]. 济宁医学院学报, 2017, 40(4): 295-300. DOI: 10.3969/j.issn.1000-9760.2017.04.015.
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LIU Xin, YAN Bo. Recent progress of SIRT7 biological function and human disease[J]. Journal Of Jining Medical University, 2017, 40(4): 295-300. DOI: 10.3969/j.issn.1000-9760.2017.04.015.
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作者简介

刘新,济宁医学院2014级研究生

通信作者

闫波, E-mail:yanbo@mail.jnmc.edu.cn;

文章历史

收稿日期:2017-04-08
SIRT7生物学功能与人类疾病研究进展
刘新    综述, 闫波    审校    
济宁医学院, 济宁 272067;济宁医学院附属医院, 济宁 272029
摘要: SIRT7是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)依赖的第三类去乙酰化酶sirtuins家族成员之一。尽管SIRT7是迄今sirtuins家族中研究最少的成员,但是最近的突破性研究使其去乙酰化活性及生物功能日渐清晰。SIRT7是sirtuins家族中唯一位于核仁的蛋白。在有丝分裂中,SIRT7介导rDNA转录激活。SIRT7通过其去乙酰化活性与P53、H3K18、PAF53、NPM1、GABP-β1和U3-55k等多种底物蛋白相互作用,参与调控细胞增殖、衰老、凋亡等多种细胞进程,并在应激条件下参与调节细胞生存与凋亡的平衡。SIRT7在细胞代谢过程中发挥重要作用,参与恶性肿瘤、心血管疾病、脂肪肝及糖尿病等疾病的病理性进展。本文总结了近年来SIRT 7的研究进展,就其生物学功能与人类疾病的相关性作一综述。
关键词: SIRT7    去乙酰化活性    应激    代谢    
Recent progress of SIRT7 biological function and human disease
LIU Xin, YAN Bo    
Jining Medical University, Jining 272067, China;The Affiliated Hospital of Jining Medical University, Jining 272029, China
Abstract: SIRT7 is a member of the sirtuin family of nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+)-dependent class Ⅲ deacetylase.Although SIRT7 is the least studied, recent breakthrough studies have elucidated its acetylation activity and biological functions.SIRT7 is the only one localized to the nucleus in Sirtuin family.During the mitotic process, SIRT7 mediates the activation of rDNA transcription.By interacting with P53, H3K18, PAF53, NPM1, GABP-β1, U3-55k and other substrates, SIRT7 regulates cell proliferation, senescence, apoptosis and other cellular processes.Under stress conditions, SIRT7 plays an important role in regulating the balance of cell survival and apoptosis, as well as metabolisms.SIRT7 has been implicated in the pathological progression of malignant tumor, cardiovascular disease, diabetes and fatty liver.In this review, we summarize the recent progress of SIRT7, focusing on the relationship between its biological functions and human diseases.
Key words: SIRT7    Deacetylase activity    Stress    Metabolism    Human disease    

沉默信息调节因子(silent information regulator 2,Sir2) 家族是一类从古细菌到人类高度保守NAD+依赖的组蛋白去乙酰化酶类,属于第三类去乙酰化酶(HDAC)。Sir2最初在酵母中被发现,随着Sir2同源基因在其他物种相继发现,现已将各物种的Sir2蛋白质统称为Sir2相关酶类(sirtuins)[1]。在哺乳动物中,Sir2存在7种同源基因,SIRT1-7。哺乳动物的sirtuins家族成员分为4类:第Ⅰ类包括SIRT1、SIRT2和SIRT3;第Ⅱ类,SIRT4;第Ⅲ类,SIRT5;第Ⅳ类,SIRT6和SIRT7。SIRT1-7在细胞中的定位也具有差异:SIRT1和SIRT6位于细胞核,SIRT 2主要位在细胞质,SIRT 3, 4和5在线粒体内,SIRT 7位于核仁中。SIRT1-7在不同组织中的表达水平也各异。SIRT1-7的去乙酰化酶活性具有生物学功能的多样性,根据其在细胞内的分布,其生物学功能不尽相同,参与细胞衰老、维持基因组的稳定性、肿瘤的发生及应激反应等过程的调控[2]。随着近年来对于SIRT 7参与各种细胞进程的突破性研究,其生物学功能也逐渐清晰。本文总结了近几年对SIRT 7的研究,将就其基因结构及亚细胞定位、表达调控、酶学活性、生物学功能和疾病的相关性等方面作一综述。

1 SIRT7基因及蛋白亚细胞定位

SIRT7基因定位于17号染色体(17q25.3),基因序列跨度为6.2kb范围,包括10个外显子。SIRT 7基因编码400个氨基酸,第3~9外显子编码SIRT 7蛋白的NAD+依赖的去乙酰化酶催化结构域[3],两侧有N-端和C-端结构域,最新研究发现N-端为三螺旋结构,N-端和C-端结构域在SIRT7的可溶性表达中发挥重要作用[4]

SIRT7是sirtuins家族中唯一定位于核仁的蛋白[3, 5]。SIRT7通过其氨基酸序列中的两个定位信号定位于核仁区:核定位信号(NLS)位于61~75氨基酸序列,核仁信号(NoLS)位于C-端的392~400氨基酸序列[5]。最近研究发现,SIRT7在人乳腺癌细胞和小鼠胚胎成纤维细胞(MEF细胞)的胞浆及核仁中均检测出来[5-7]。SIRT7特殊的定位提示其与rDNA转录、核糖体的生物合成及细胞增殖有关。

2 SIRT7基因的表达及调控

SIRT7基因广泛表达于人体不同器官和组织,在脾脏中的表达水平较低。SIRT7基因在小鼠增生旺盛组织如脾、肝和睾丸中广泛表达,在骨骼肌、心脏和大脑等组织中低水平表达[3]。在不同器官和组织中,SIRT7主要作为一个正性或负性调控因子发挥作用。在小鼠衰老过程中,SIRT7在造血干细胞中的转录水平降低,而在初级人乳腺上皮细胞中,其转录水平是升高的。在人肺的初级成纤维细胞的进行性衰老中,SIRT7转录水平降低,且随着细胞复制的进行,核仁的SIRT7蛋白也进行性丢失[5]。同时,SIRT7的表达与细胞增殖、分化及应激反应等状态有关。当人体应用衣霉素治疗导致内质网应激时,以及在甲状腺癌、乳腺癌、膀胱癌及肝癌的癌组织中,可发现SIRT7表达水平上调[8-9]。而在应用靶向化学药物治疗的癌细胞系MCF-7、Saos-2及A2780中,其SIRT7表达水平呈下降趋势。在氧化应激时,SIRT7的转录水平在大鼠胚胎心脏来源的H9c2细胞中轻度下调[10]

目前已知的SIRT7基因表达调控因子较少。Kim等[9]首先报道了微小RNA(microRNA)的miR-125a-5p为内源性的SIRT7调控因子。miR-125b通过结合SIRT7的3’-UTR区域调控其表达。另外一个SIRT7的调控因子为Mybbp1a[11]。Mybbp1a蛋白可通过其C-端区域与SIRT7蛋白的N-端和C-端区域发生相互作用来抑制SIRT7的去乙酰化酶活性[12]

3 SIRT7的去乙酰酶化作用

目前,SIRT7的生物学功能主要归因为酶学活性,但其作用底物尚不明确,其去乙酰化活性尚存在争议。Vakhrusheva等[13]研究发现SIRT7基因敲除小鼠P53基因的382位Lys残基乙酰化水平增高,同时P53基因水平也增高了,提出在体外SIRT7可与P53相互作用并使其脱乙酰化。而Barber等[14]发现P53的去乙酰化无论是在体内或细胞内均与SIRT7无关。Kim等[9]发现在应用SIRT7抗体的Hep3B细胞中P53的去乙酰化水平增高。因此,SIRT7对P53的去乙酰化仍存在争议,有待进一步去证实。有研究发现,SIRT7可通过去乙酰化组蛋白H3K18抑制由Pol Ⅱ介导的mRNA的转录,并且SIRT7只作用于H3K18组蛋白,而不影响其他组蛋白[7]。另外一个SIRT7的酶作用底物为PAF53,PAF53是RNA聚合酶Ⅰ的一个亚单位。在一定的压力下,SIRT7由核仁转移至核浆使PAF53乙酰化,从而抑制Pol Ⅰ的转录[15]。SIRT7也可通过去乙酰化作用活化转录因子GABP-β1,调控核编码的线粒体生物合成相关基因的转录[16]。另外,核仁磷酸蛋白NPM1也参与SIRT7的去乙酰化。当SIRT7过表达时,可使NPM1的乙酰化水平降低[17]。最近研究发现,SIRT7可去乙酰化U3-55k蛋白调控rRNA前体的加工,从而参与核糖体的生物合成过程[18]

在体外,SIRT7的去乙酰化酶活性极低,双链DNA(dsDNA)可以显著提高SIRT7的去乙酰化酶活性,且允许在染色质区域去乙酰化H3K18,而且,SIRT7是一种RNA活化的蛋白赖氨酸去乙酰化酶,RNA可以提高SIRT7的催化效率。在体外,rRNA和tRNA都是SIRT7的强效活化剂。SIRT7主要的内源性结合片段是rRNA,在体外rRNA可以有效激活SIRT7[19]

4 SIRT7的生物学功能 4.1 参与rDNA转录

SIRT7可通过与上游结合因子(UBF)及RNA聚合酶Ⅰ(pol Ⅰ)相互作用参与激活rDNA(核糖体DNA)转录[20]。SIRT7基因过表达可增加RNApol Ⅰ介导的转录,SIRT7基因敲除则显著减少rRNA的表达水平。敲除SIRT7基因可使rRNA合成速率减少50%[16]。SIRT7基因的下调可通过减少核糖体蛋白RPA194(RNA聚合酶最大的亚基)的表达水平使rRNA的表达水平降低[12]。SIRT7基因激活rDNA转录依赖于NAD+介导的去乙酰化酶活性,其酶作用底物尚不清楚。有研究报道SIRT7可通过介导PAF53的第373位赖氨酸残基去乙酰化影响rDNA的转录。PAF53为RNApol Ⅰ复合体的一部分,可通过与pol Ⅰ的CAST/Hpaf49残基及UBF相互作用促进rRNA与rDNA结合[21]。最近研究发现,SIRT7还可通过去乙酰化U3-55k和PAF53蛋白增强rRNA前体的合成和加工,从而参与核糖体的生物合成过程[18]

4.2 参与蛋白质合成

Kim等[9]首先报道了SIRT7参与蛋白质合成,发现敲除SIRT7基因的肝脏癌细胞可使质粒中蛋白质水平下降。后Tsai等[12]研究发现,SIRT7与Pol-Ⅲ的特定转录因子TFIIIC2相互作用,减少RNAPol-Ⅲ复合体,而Pol-Ⅲ参与tRNA和5sRNA的生物合成,从而影响蛋白质的水平。但是,SIRT7过表达不增加蛋白质的合成效率,提示SIRT7对蛋白质合成的影响是间接的。

4.3 参与染色质重塑过程

目前已知,sirtuins家族成员可使组蛋白发生去乙酰化,从而介导染色质的重塑过程。其中,SIRT7可与B-WICH染色质重塑复合体及pol Ⅰ相互作用介导rDNA转录到染色质重塑的过程[12],提示SIRT7可通过与染色质重塑复合体B-WICH相互作用促进rDNA转录。

4.4 参与应激反应

SIRT7在细胞处于应激条件下对机体具有保护性作用,可抵抗各种应激如缺氧[22]、未折叠蛋白反应引起的内质网应激[8, 23]、遗传毒性应激[24]。例如,缺氧诱导因子(HIF-1和HIF2) 是具有调控转录活性的核蛋白,在缺氧条件下通过与靶基因(如促红细胞生成素、超氧化物歧化酶和血管内皮生长因子基因等)结合后, 通过调控其基因表达,导致机体产生一系列代偿反应,同时也产生机体的病理性损伤。正常条件下,合成的HIF蛋白很快即被细胞内氧依赖性泛素蛋白酶降解途径所降解。SIRT7基因的过表达可以下调HIF靶基因的表达而不依赖于体内的蛋白酶体降解途径。SIRT7基因敲除可使HIF蛋白表达增加,并在缺氧时增加HIF的转录活性[22]。因此,SIRT7在缺氧导致的应激反应中发挥对机体的保护作用。

4.5 调控细胞衰老及凋亡

Sir2最初在芽殖酵母菌中发现具有延长生命周期的作用,作为Sir2同源基因的sirtuins家族也被认为参与调控细胞衰老的过程。Vakhrusheva等[13]发现SIRT7基因敲除小鼠的平均寿命和最大寿命均降低。随后,人们发现56周龄的衰老小鼠肝细胞以及24周龄的老年大鼠相比于年轻的同种鼠SIRT7呈低水平[17]。转染了SIRT7基因的小鼠胚胎癌细胞系P19细胞生长速度明显减慢,同时出现了G1到S期细胞周期阻滞。最近研究表明,SIRT7可改善老年人的造血干细胞的再生能力[23],miR-152可通过抑制SIRT7的表达来诱导人牙髓干细胞衰老[25],这些都提示SIRT7参与细胞周期及细胞凋亡的关键作用。另外,细胞衰老主要是由基因组完整性累积丢失导致的,涉及染色质重塑、转录失调及DNA损伤过程,SIRT7可通过调控非同源末端连接DNA损伤修复促进细胞基因组的稳定性[26-27],对于延缓衰老、延长寿命方面具有重要的意义。

5 SIRT7与疾病 5.1 心血管疾病

Vakhrusheva等[13]证明了纯合SIRT7基因敲除小鼠死亡早于野生型小鼠,并且表现出老化相关的表型;与此相反,杂合SIRT7基因敲除小鼠未表现出任何异常表型。SIRT7基因敲除小鼠在7月大的时候出现老年退行性心脏肥大,而这种肥大在小鼠早期生命阶段(0~3月)并未观察到,其原因可能是AKT或RAS途径活化等改变的结果。SIRT7基因敲除小鼠心肌细胞凋亡显著,组织学检查显示心脏组织呈纤维化改变,细胞中胶原Ⅲ和胶原Ⅳ的积聚和溶酶体脂褐素沉积。另外,小鼠心肌组织中存在炎症反应,血液中T淋巴细胞和粒细胞数量增加,白细胞介素12、13水平升高,提示SIRT7基因敲除小鼠易患心肌肥大和炎症性心肌病。在SIRT7基因敲除小鼠中还发现,血乳酸水平升高,对身体活动的耐力降低和心肌细胞供血不足。心肌缺血导致细胞供氧减少,进而引起复合体Ⅰ和复合体Ⅳ参与的线粒体有氧呼吸减弱,导致血乳酸水平升高[28]

5.2 癌症

在一些癌症病人中,SIRT7呈高水平表达,提示SIRT7高水平表达可能具有致癌潜力。首先,SIRT7 mRNA被发现在乳腺癌组织中的表达水平较正常乳腺组织高,并且相较于淋巴阴性乳腺癌,其在淋巴阳性乳腺癌中表达水平进一步上调。随后,Barber等[14]提出癌细胞中的SIRT7对于癌细胞表型的维持至关重要。SIRT7可通过去乙酰化H3K18导致肿瘤的发生,低生存率的侵袭性肿瘤及癌细胞的转变往往与H3K18的去乙酰化状态相关。肿瘤抑癌基因NME1和COPS2可被转录因子ELK4抑制,而ELK4通过调控SIRT7作用于相应的靶基因。敲除ELK4可使抑癌基因的特定部位SIRT7显著下降,进而引起H3K18的乙酰化水平升高,缓解SIRT7过度表达对肿瘤抑癌基因的抑制。因此,SIRT7参与下调一些肿瘤抑制基因,导致癌症的发生。SIRT7在肝癌患者及肝癌细胞系中高表达,敲除肝细胞肝癌细胞系中的SIRT7基因可通过降低P21基因的表达2水平和增加细胞周期蛋白D1的水平,导致G1到S期细胞周期阻滞,从而抑制其生长速率。而肝细胞肝癌中的SIRT7高表达是受microRNA的miR-125a-5p和miR-125b调控的。细胞内的miR-125a-5p和miR-125b被甲基化后,其在细胞内的水平下降,导致SIRT7高表达,最后细胞凋亡减少,癌细胞增殖[9]。该miR-125b调控SIRT7表达途径在膀胱癌和大肠癌细胞中也有类似研究报道[29-30]。另外,与正常细胞相比,在卵巢癌[31]和乳腺癌细胞[32]中SIRT7水平更高。鉴于SIRT7与SIRT1存在很大的同源性,可推论SIRT7的致癌作用与NF-κB因子有关,参与调控卵巢癌细胞的增殖和凋亡[31]。在前列腺癌和胃癌中,高SIRT7水平与高侵袭性、转移及预后差相关[33]。SIRT7的表达与肿瘤的发生发展之间尚不完全清楚,有待进一步研究。

另外,最新的研究发现,放疗药物5-氟尿嘧啶可通过下调SIRT7而增加大肠癌细胞对其敏感性,增强治疗效果[34];MicroRNA-3666诱导剂则通过抑制SIRT7而抑制非小细胞肺癌细胞的生长[35]。因此,SIRT7可作为治疗癌症的潜在靶点。

5.3 肝脏脂质代谢

关于SIRT7在肝脏脂质代谢的作用,Shin[8]和Ryu[28]等认为在小鼠中敲除SIRT7基因可导致脂肪肝,Yoshizawa等[36]提出SIRT7基因敲除小鼠在进食高脂饮食时可抵抗脂肪肝的形成,提示SIRT7在脂质代谢作用机制的多样性和复杂性。Shin等[8]构建的SIRT7敲除基因模型小鼠表现为脂肪肝合并肝脂肪变性,生脂基因表达增加,脂肪酸氧化酶表达水平无变化,小鼠体重下降。可能机制为SIRT7基因缺陷时,刺激未折叠蛋白反应(UPR)激活,进而增加肝脏脂肪合成导致脂肪肝。这也提示SIRT7抵抗内质网应激(ER应激)中的关键作用[8]。在另一项研究中,给予高脂饮食后,SIRT7基因敲除小鼠较野生型小鼠能更好地抵抗脂肪肝的形成、抵抗体重增加和肥胖,肝脏体积表现为减小,糖耐量改善及胰岛素抵抗水平降低,以及胰岛素的敏感性增高。正常情况下,SIRT7能特异性抑制泛素化复合体DCAF1/DDB1/CUL4B的活性,避免TR4的降解,维持正常的脂质代谢。而敲除了SIRT7基因的小鼠,TR4/TAK1途径被激活,TR4下调,导致脂质合成减少[36]。Ryu等[28]同样发现,敲除SIRT7基因导致肝脂肪变性,但小鼠体重无明显变化。与以上两项研究不同,SIRT7参与脂肪代谢的机制与ER应激、脂肪生成基因及脂肪酸氧化酶基因的表达无关。SIRT7能够保持GABPβ1的去乙酰化状态维持其生物活性,而GABPβ1作为细胞核的转录因子负责线粒体的功能及其生物合成。SIRT7基因敲除小鼠中GABPβ1乙酰化水平升高,抑制其转录活性,导致线粒体功能障碍。

6 小结与展望

SIRT7作为sirtuins家族中的一员,是细胞的一个关键调控因子,影响多种生物过程,如转录、核糖体生物合成、染色质结构与细胞增殖。全球蛋白组学研究已经确定了几个SIRT7的靶蛋白,并且通过SIRT7基因敲除小鼠证明了这些细胞过程是受SIRT7调控。SIRT7被认为在目前发现的肿瘤类型中均是上调的,但其具体作用机制仍不清楚。而SIRT7的耗竭与DNA损伤、细胞凋亡、应激反应及疾病的发生相关。目前仍需要更多关于SIRT7的生理机制及与疾病相关的功能的研究,深入了解SIRT7在人类疾病方面的作用机制和分子治疗靶点,为人类疾病的预防与诊治提供新的方向。

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